Les cyanobactéries sont des micro-organismes présents naturellement dans l'eau douce, l'eau salée et les eaux saumâtres. Elles prolifèrent particulièrement pendant les périodes chaudes et ensoleillées, lorsque l’eau est riche en nutriments comme le phosphore et l’azote. Elles se manifestent souvent par une coloration verte, bleue ou brune de l'eau, donnant un aspect de mousse ou de peinture à la surface.